“นำนโยบายมาสนับสนุนภาคีสร้างเสริมสุขภาพ”มีหน้าที่นำนโยบายของคณะกรรมการกองทุนฯ และแผนหลักทั้ง 13 ด้านมาดำเนินงานให้บรรลุวัตถุประสงค์ การสนับสนุนภาคีสร้างเสริมสุขภาพมีส่วนร่วมพัฒนาและดำเนินกิจกรรม ตลอดจนการพัฒนาระบบและวิธีปฏิบัติงานให้มีประสิทธิภาพและมีธรรมาภิบาล ประกอบด้วย 9 สำนัก ดังต่อไปนี้
- สำนัก 1 สำนักสนับสนุนการสร้างสุขภาวะและลดปัจจัยเสี่ยงหลัก
- สำนัก 2 สำนักสนับสนุนการสร้างสุขภาวะและลดปัจจัยเสี่ยงรอง
- สำนัก 3 สำนักสนับสนุนการสร้างสุขภาวะในพื้นที่และชุมชน
- สำนัก 4 สำนักสนับสนุนการสร้างการเรียนรู้และสุขภาวะองค์กร
- สำนัก 5 สำนักรณรงค์และสื่อสารสาธารณะเพื่อสังคม
- สำนัก 6 สำนักสนับสนุนโครงการเปิดรับทั่วไป
- สำนัก 7 สำนักวิชาการและ ทุนทางสังคม
- สำนัก 8 สำนักพัฒนายุทธศาสตร์ แผนและสมรรถนะ
- สำนัก 9 สำนักพัฒนาวิชาการ